Les micro-organismes végétaux des fruits et légumes stimulent la diversité intestinale

La diversité bactérienne dans l’intestin joue un rôle important dans la santé humaine. Mais la question cruciale est de savoir où se trouvent les sources de cette diversité ? On sait qu’une partie importante du microbiome maternel est transférée au bébé à la naissance, et la même chose se produit pendant la période d’allaitement via le lait maternel. D’autres sources restaient encore à découvrir. Cependant, une équipe dirigée par Wisnu Adi Wicaksono et Gabriele Berg de l’Institut de biotechnologie environnementale de l’Université technologique de Graz (TU Graz) a réussi à prouver que les micro-organismes végétaux des fruits et légumes contribuent au microbiome humain. Ils rapportent cela dans une étude publiée dans la revue Microbes intestinaux.

Tu es ce que tu manges

Les auteurs ont pu démontrer que la fréquence de consommation de fruits et légumes et la variété de plantes consommées influencent la quantité de bactéries associées aux fruits et légumes dans l’intestin humain. La petite enfance, en particulier, représente une fenêtre d’opportunité pour la colonisation par des bactéries associées aux plantes. Il a également été démontré que les micro-organismes d’origine végétale possèdent des propriétés probiotiques et bénéfiques pour la santé.

Un microbiome est l’ensemble de tous les micro-organismes qui colonisent un macro-organisme (humain, animal, végétal) ou une partie de celui-ci, par exemple l’intestin ou un fruit. Alors que les microbiomes individuels sont de mieux en mieux compris, on sait peu de choses sur leurs connexions. « La preuve que les micro-organismes des fruits et légumes peuvent coloniser l’intestin humain a été établie pour la première fois », explique le premier auteur Wisnu Adi Wicaksono. Cela suggère que la consommation de fruits et légumes, en particulier pendant la petite enfance, a une influence positive sur le développement du système immunitaire au cours des trois premières années de la vie, à mesure que le microbiome intestinal se développe pendant cette période. Mais même après cela, une bonne diversité de bactéries intestinales est bénéfique pour la santé et la résilience. « Cela influence tout simplement tout. La diversité influence la résilience de l’organisme tout entier ; une plus grande diversité entraîne plus de résilience », explique Gabriele Berg, directeur de l’Institut.

Plusieurs milliards de séquences

Afin de pouvoir déterminer que la consommation de fruits et légumes et de leurs microbiomes entraîne effectivement des modifications du microbiome intestinal, l’équipe a d’abord créé un catalogue de données sur le microbiome des fruits et légumes qui leur a permis d’attribuer leurs bactéries. Ils les ont comparés aux données accessibles au public provenant de deux études sur la flore intestinale. Le projet TEDDY a étudié le développement des bébés dans le cadre d’une étude à long terme et l’American Gut Project a étudié le microbiome intestinal des adultes. Les deux projets ont également collecté des données sur la consommation alimentaire des personnes testées. Au total, les chercheurs disposaient de données métagénologiques provenant d’environ 2 500 échantillons de selles, contenant chacun entre un et dix millions de séquences – plusieurs milliards de séquences ont ainsi été évaluées. Grâce à ce vaste ensemble de données, la présence de microflore de fruits et légumes dans l’intestin a pu être démontrée. Ces preuves constituent un élément crucial pour prouver le concept One Health de l’OMS, qui lie étroitement la santé humaine, animale et environnementale.

Étude de suivi sur trois continents

Pour explorer davantage ce lien, Gabriele Berg, de l’Institut de biotechnologie environnementale, travaille déjà avec des collègues internationaux et dans le cadre du projet HEDIMED financé par l’UE (www.hedimed.eu) sur une étude d’intervention dans laquelle les gens de trois continents mangent exactement la même chose. choses pendant un certain temps, après quoi leurs excrétions sont analysées. Mais au-delà de cela, Gabriele Berg voit de nombreux domaines qui pourraient être influencés par les résultats de l’étude. Cela commence par la production alimentaire, car le sol, les engrais et les pesticides affectent le microbiome des plantes.

« Les fruits et légumes frais auront toujours le meilleur microbiome ; les entreprises agricoles ou de transformation ont déjà une influence majeure ici. Et le stockage et la transformation des aliments doivent également être reconsidérés de manière critique », explique Berg. En fonction des résultats de l’étude prévue, des applications intéressantes pourraient également être envisagées pour les particuliers. « Chaque fruit et légume possède un microbiome unique. Alors peut-être qu’à un moment donné, un régime personnalisé pourra être élaboré sur cette base. »